却让酋雷姆和捷克罗姆b2或雷希拉姆w2合体。最后，酋雷姆被主角制服，合众地方免于受到危机。
就在这段时间里，卡洛斯地方的闪焰队打算使用“最终兵器”改变这个世界。因而唤醒了哲尔尼亚斯x或伊裴尔塔尔y。主角制伏了它们以后，卡洛斯地方3000年前的国王az的后代，闪焰队首领弗拉达利使用能进行超进化的神奇宝贝打算阻止主角离开闪焰队秘密基地。最后，主角成为冠军，回到密阿雷市接受表扬。az与花叶蒂再次相遇。卡洛斯地方脱离了危险。
文化：
在神奇宝贝世界，神奇宝贝和人类一起生存，作为训练家的人类会收服神奇宝贝，训练神奇宝贝，和神奇宝贝一起对战，培育神奇宝贝，或者把神奇宝贝作为宠物，亦或作为一门研究的学科，或利用神奇宝贝的能力完成各种工作。许多神奥传说也说人类与神奇宝贝的关系非常亲近，历史上甚至有一段不分彼此的时期。
广义地说，神奇宝贝训练本身就是基于两个这样的问题：训练家和神奇宝贝应该有怎样的关系，如何才能增进这种关系。因为有着不同的观点，不同的训练家也会有不同的训练方式，专长于不同的领域。并没有任何一种方式是正确的训练方式，每一种方式都有其有利于不利的一面。
然而，许多训练方式最终其实都分属两类。第一类是专注于神奇宝贝的感受和幸福，建立强大的友谊；第二类是专注于神奇宝贝的力量和能力。训练家经常会为这两种观点争执不休。在神奇宝贝系列的价值观里，则突出地强调训练家与神奇宝贝之间，友情才是最重要的，而只要有爱与关心，就能发挥出任何神奇宝贝的强大力量。
神奇宝贝世界史显然与现实世界不同，并侧重于描写人类与神奇宝贝相处的部分。在世界上并没有主要的宗教，但许多信仰和神话都围绕着传说中的神奇宝贝，所以也可以说，神奇宝贝是这个世界人类的主要信仰。而且，许多人类都对神奇宝贝表现出友好和尊重，世界各地也有与神话传说相关的神殿。
然而，也有许多人希望利用神奇宝贝满足自己的野心。有些人希望获得物质的收获，而有些人则希望达成一些不被这个世界接受的理想。另外，至少在历史上，神奇宝贝世界曾有过战争，并且分属不同阵营的神奇宝贝也曾参与其中。
神奇宝贝是神奇宝贝世界之中，和人类一起生活的生物。许多人类尊重并善待神奇宝贝，也有一些人类试图滥用神奇宝贝。神奇宝贝具有感情，并在某种程度上能理解人类的语言。生态环境的变化也受神奇宝贝的影响。和现实世界的生物相比，许多神奇宝贝拥有超出现实世界生物的能力。
进化：
在神奥传说中，神奇宝贝和人类最初并不分彼此，属于同一个种群。随着时间的推移，一部分生物演变形成了人类。这种说法在神奇宝贝世界中提到很多次，但并未得到证实。梦幻是所有生物的祖先，它演化成为其它神奇宝贝。最早的人类诞生于数百万年前的石器时代。在生物学和遗传学上，所有的神奇宝贝都同属一种物种的不同分支，所以虽然不同种的神奇宝贝也有可能在饲育屋中生蛋。
在现代的神奇宝贝世界，进化一词专指神奇宝贝在生长到一定阶段、或在特定条件下转变为另一种神奇宝贝的过程。进化并不只是体型变大，一般进化型态的神奇宝贝拥有更强大的种族值，学会不同的技能，甚至改变属性。许多神奇宝贝都可以进化。
神奇宝贝的进化，更类似于现实世界的生物变态而非进化，和进化一词相似的神奇宝贝进化是结草儿，它会根据环境来改变进化后的型态。
繁殖：
几乎所有神奇宝贝都可以进行繁殖。完全进化的，或者经过幼年型态的神奇宝贝可以和相同蛋群的神奇宝贝生蛋。没有性别的神奇宝贝也可以和百变怪生蛋。除了玛纳霏和霏欧纳之外，幼年型态的神奇宝贝以及传说中的神奇宝贝不可以生蛋。和现实世界的生物一样，许多神奇宝贝有性别之分，有些神奇宝贝可以通过性别差异分辨。通常，训练家神奇宝贝一般在神奇宝贝饲育屋中生蛋。神奇宝贝繁殖的方式并不为人所知，也不为人所见。
神奇宝贝在出生之前生活在蛋里，神奇宝贝蛋有坚硬的外壳保护它的成长。蛋的外形通常会有所属的神奇宝贝的花纹。和现实世界的动物一样，神奇宝贝会竭力保护它们的蛋，把蛋守护在离它们很近的地方。在成长到一定程度后，神奇宝贝就会从蛋中孵化出来。神奇宝贝孵化所需要的时间依神奇宝贝的种类而有所不同，但若把蛋存放在电脑里，蛋的成长就会暂停。
有些神奇宝贝有幼年型态。幼年型态的神奇宝贝在进化之后，就可以进行繁殖。许多存在幼年型态的神奇宝贝的蛋只会孵化成为幼年型态；然而有些神奇宝贝的蛋一般会孵化成略成熟一些的型态，只有在生蛋时携带对应的熏香，才会使蛋孵化成幼年型态。
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